二代转录组测序已经如火如荼的开展了近十几年，关于mRNA研究的文章也呈爆发式的发展，但是最近几年单纯的mRNA检测似乎不再那么吃香了。我们来看一组数据，下图是Pubmed数据库中检索mRNA得到的相关的文献信息，数据显示2015年时普通mRNA文献已经达到峰值，随后关于mRNA的文章开始有下滑的趋势。

那么问题来了，还有什么技术可以达到科研目的，又不显得那么过时呢？不着急，全转录组测序来助你！全转录组是指特定组织或细胞在特定状态下所有转录产物的总和，包括mRNA和各种noncoding RNA。机体内除了mRNA转录翻译成蛋白质行使功能以外，noncoding RNA在转录调控中占有重要的作用。像近几年来比较火热的竞争性内源RNA(ceRNA)调控机制也属于全转录组研究的范畴内。那不多说，直接上文献，有文献有真相。

 

研究内容

本文先是对HBV相关肝纤维化（n = 10）患者和健康对照组（n = 8）进行血浆小RNA测序，根据差异基因和研究背景锁定目标研究对象“miR-185-5p”。qPCR和WB检测miR-185、以及肝纤维化特征基因RNA和蛋白表达水平。随后通过细胞学实验、体外实验、小鼠模型实验等，发现miR-185通过靶向RHEB和RICTOR抑制HSC的活化，并且观察到的纤维化与miR-185表达之间的负相关关系，可用于评估纤维化的严重程度。为了进一步研究是否可以将miR-185鉴定为疾病进展的候选预测指标，需要具有可比临床病理特征和完整随访数据的更大队列研究。

 

研究内容

在本研究中，为了评估circRNA在人体内的作用，作者采用了高通量测序方法，测定TLE患者和非TLE患者颞叶新皮质中circRNA表达水平，并对环状RNA的功能进行注释。同时对circRNA表达谱进行了全面的分析，确定了癫痫患者的8个circRNA。其中显著差异表达的circ-EFCAB2和circ-DROSHA可能是通过调节来源基于EFCAB2和DROSHA参与TLE，也可能作为miRNA的海绵影响靶基因的表达，参与TLE的发病机制。描述了一个包含潜在基因与circRNA-miRNA的网络。

 

 

研究内容

作者研究长链非编码RNA (lncRNAs) 在肺癌中的作用。作者使用微阵列来研究P53敲除和KRAS-G12D突变小鼠肺腺癌中异常表达的lncRNAs。结果表明，shRNAs敲除NONMMUT015812可降低KP细胞的增殖和迁移能力。在小鼠肺腺癌中异常表达的lncRNAs中，NONMMUT015812是一个潜在的致癌基因。

 

好啦，今天文献就说到这里。上述文献是不是有种似曾相识的感觉，10年前，转录组按照“测序-找差异-功能描述”这套思路也可以发个比较好的文章，这几年却不能了。但是现在全转录正在开启这种模式，你有没有get到！