非靶向代谢组(untargeted metabolomics)是一种常用广泛筛选的代谢物的的代谢组学研究方法,作为表观的最直接体现者,近年来来一直深受各位学者的追捧。随着检测技术手段的不断升级,为了提供更好更高质量的代谢组学数据,?不断的加大研发的力度,提升非靶向代谢组的检测质量,以挖掘到样本中更多更准代谢物信息,如何在7天内快速做完一个非靶向代谢组的项目?
选用超优的平台
首先要选用高分辨Water Q-TOF质谱平台和成熟稳定的质控体系,提供准确优质数据,平台特点:
- 双离子ESI源,专利LockSpray实时在线矫正技术(高稳定性)—数据可靠
- StepWave 技术,保证满足痕量检测的要求(高灵敏度)—低丰度物质(新物质,不曾报道的,好发文章)
超全的数据库
欲善其事必先利其器,数据库是代谢物定性的根本利器,百迈客对本地数据库不断升级扩大,升级后本地数据库物质5000+代谢物,自建库在行业中位居前列。
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画图工具
文献里面好看又直观的的美图是如何制作出来哒?比如韦恩图、箱形图等。这就需要用到一些画图工具,这里推荐百迈客云在线分析工具,百迈客云有104款分析小工具,涵盖基因分析、遗传进化、ncRNA、质控、组装、比对、数据提取、突变、统计、表格处理、绘图、序列分析等12大功能,非常齐全。
代谢组可以反映生物体表型的状态变化。代谢组与转录组、蛋白组的多组学联合分析可以同时实现从多个层面来探究生物学问题,相互间进行验证,从海量的数据中筛选出关键基因、蛋白质及代谢通路,解释生物过程的复杂性和整体性,提高文章的水平。下面为大家推荐几篇代谢组多组学联合分析的文献。
案例一
期刊:Journal of Hazardous Materials
IF:14.224
单位:河南科技学院?河南农业大学
研究方法:代谢组学?转录组学 蛋白质组学
案例二
期刊:Frontiers in Plant Science
IF:6.627
单位:黑龙江八一龙垦大学
研究方法:非靶代谢组学+转录组学
案例三
单位:西南大学
期刊:Environmental and Experimental Botany
IF:6.028
研究策略:转录组 +代谢组+ICP-MS离子组学
案例四
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单位:中国科学院西北生态环境资源研究所
期刊:International Journal of Molecular Sciences
IF:4.556
研究策略:微生物组学 +代谢组学
案例五
单位:四川农业大学
期刊:Frontiers in Plant Science
IF:6.627
研究策略:转录组学 +代谢组学
案例六
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单位:甘肃农业大学
期刊:Frontiers in Microbiology
IF:6.064
研究策略:转录组学 +代谢组学+微生物组学
案例七
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单位:石河子大学
期刊:Frontiers in Plant Science
IF:6.627
研究策略:转录组学 +代谢组学+微生物组学
案例八
单位:新乡医学院
期刊:Science of the Total Environment
IF:10.753
研究策略:微生物多样性+代谢组
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百迈客生物代谢组项目优势
超广项目经验
百迈客近一年已完成非靶代谢组项目经验2w+,为使老师更直观的认知百迈客非靶向代谢组产品,我们对2022年300多个项目数据进行了统计,包含物种信息、样本类型及检出通量。
- 超全样本类型
物种类型涵盖丰富,包括动物,植物,微生物,细胞类型样本,小编整理一下近半年的部分样本类型展示如下表。
样本 | 物种 | 样本 | ? | 样本 | 物种 |
植物 | 法国梧桐 | 动物 | 虹鳟 | 微生物 | 阿萨希丝孢酵母 |
三色堇 | 小鼠 | 凝结芽孢杆菌 | |||
桃 | 绵羊 | 土壤 | |||
茶树 | 兔子 | 红曲霉 | |||
麦冬 | 断奶仔猪 | 微生物 | |||
桑树 | 人 | 浓香型大曲 | |||
野牛草 | 兔子 | 酒醅 | |||
铁皮石斛 | 鸽 | 梭菌 | |||
绢蒿 | 小鼠 | 真菌 | |||
青稞 | 黇鹿 | 芽孢杆菌 | |||
紫苏 | 大黄鱼 | 酵母菌 | |||
杜仲 | 草地贪夜蛾 | 链霉菌 | |||
玉米 | 麦蛾柔茧蜂(蛹) | 其他 | 细胞 | ||
紫花苜蓿 | 贻贝 | ….. | |||
青稞(大麦) | 小金蝠蛾 | ||||
菊花 | 鸡 |
- 超高检测通量
小编统计了2022年近两个月的植物样本的非靶物质检出情况,植物样本中二级鉴定到的物质数量最高4700,平均检出3199个物质,随后随机抽取了20个项目,涉及不同物种,针对植物样本中二级鉴定到的物质数目,绘制成了以下:
超高检测稳定性
小编对部分植物项目的检出情况进行了归纳,得到了各个检出水平的项目占比,具体如下图:
从图可以看到植物样本,85%以上的项目二级检出物质数均在2000+个以上,65%以上的项目二级检出物质数均在3000个以上,通过这些项目实测数据足以看出,百迈客非靶产品对代谢物鉴定具有强大检测能力!
?超全物质覆盖度
非靶向代谢组学技术无偏向性捕获代谢物数据,小编统计了部分项目,主要检出类别如下表:
Class | 分类 | Class | 分类 |
Organooxygen compounds | 有机氧化合物 | Nucleotides and derivatives | 核苷酸及其衍生物 |
Carboxylic acids and derivatives | 碳水化合物及其衍生物 | Organonitrogen compounds | 有机氮及其衍生物 |
Coumarins and derivatives | 香豆素及其衍生物 | isflavoids | 异黄酮 |
Benzene and substituted derivatives | 苯及其取代衍生物 | fatty acids | 脂肪酸类 |
Flavonoids | 黄酮类化合物 | glycerolipids | 甘油脂类 |
Phenols | 酚类化合物 | glycerophospholipids | 甘油磷脂类 |
Indoles and derivatives | 吲哚及其衍生物 | sphingolipids | 鞘脂类 |
Aminno acids and derivatives | 氨基酸及其衍生物 | prenol lipids | 孕烯醇酮脂类 |
Carboxylic acids and derivatives | 羧酸及其衍生物 | saccharolipids | 糖脂类 |
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